Aux économies d’eau s’ajoute aussi la dépollution. En effet, contrairement à la pisciculture, l’eau chargée en ammoniac est réutilisée pour alimenter les bactéries puis les plantes, supprimant ainsi le facteur pollution de l’eau existant dans la production traditionnelle de poissons.
De plus, le circuit étant fermé, il n’y a aucun rejet d’eau dans la nature.